Multidisiplinær workshop: Introduksjon til dataanalyse og tolkning i klinisk metagenomikk

Hva prøver sekvenseringsdataene å fortelle deg? Metagenomikk kan i prinsippet påvise nesten hva som helst. Utfordringen er å finne ut hva som faktisk betyr noe. 

Dette er ikke et kodekurs, og du trenger ingen programmeringserfaring. Vi bruker eksempeldatasett og vil gå igjennom ferdige, trinnvise metagenomiske arbeidsflyter i Galaxy (en brukervennlig, nettbasert analyseplattform). Workshopen fokuserer på noen av de viktigste spørsmålene rundt tolkning av resultater: 

Er funnet reelt? Er det kontaminasjon? Er det klinisk relevant? Kan vi stole på resultatet? 

Deltakerne vil jobbe med realistiske kliniske kasus i små, tverrfaglige grupper av klinikere, laboratoriepersonell/bioingeniører, og dataanalytikere. 

Programmet vil dekke både 16S og shotgun-metagenomikk, Illumina og Oxford Nanopore, kvalitetskontroll, kontaminasjon, databaser, analyser, feilkilder og klinisk tolkning, med nasjonale og internasjonale foredragsholdere fra både sykehus og forskningsmiljøer. 

40 plasser. Påmeldingsfrist 15. februar. 

Praktisk informasjon:

• Dato: 27.- 28.april 2027
• Sted: Scandic, Lillestrøm
• Kursavgift: Gratis. Det er 40 plasser på kurset. 
• Overnatting og reise: Reise og overnatting dekkes av den enkelte deltaker. NorPreM reservererhotellrom,og du bestiller overnatting i forbindelse med påmeldingen. Kostnaden for overnattingenbetales av denenkelte deltaker direkte til hotellet ved innsjekk.
• Reise: dekkes av deltakerne selv.