Spredning av bakterier som er tilpasset sykehusmiljøet, resistente mot antibiotika eller har økt evne til å forårsake sykdom, kan få store konsekvenser for pasientsikkerhet og helsevesenet. Tidlig oppdagelse av smitteutbrudd og identifisering av mulige smittekilder er avgjørende for å kunne iverksette effektive smitteverntiltak.
Det finnes i dag ingen nasjonal løsning for samlet lagring, sammenligning og deling av mikrobielle helgenomdata med tilhørende kliniske og epidemiologiske metadata. Dette gjør det utfordrende å oppdage og følge opp smitteutbrudd på tvers av helseforetak og helseinstitusjoner.
Prosjektet Nasjonal mikrobiologisk overvåkingsdatabase kartla behov og forutsetninger for etablering av en nasjonal infrastruktur for innsamling, lagring, analyse og deling av mikrobielle helgenomdata. Arbeidet ble gjennomført av en nasjonal prosjektgruppe med representanter fra mikrobiologiske fagmiljøer i alle fire helseregioner, og inkluderte vurdering av tekniske løsninger, metadata, bioinformatikk, personvern og organisering.
Prosjektet utarbeidet anbefalinger for hvordan en fremtidig overvåkingsdatabase bør etableres. Løsningen skal kunne støtte kvalitetssikring og analyse av sekvensdata, sammenligning av bakteriestammer, overvåking av antibiotikaresistens og raskere oppklaring av infeksjonsutbrudd. Det ble også anbefalt å etablere felles standarder, sikre nødvendig IT- og bioinformatikkkompetanse og involvere de mikrobiologiske fagmiljøene i videre utviklingsarbeid.
En nasjonal mikrobiologisk overvåkingsdatabase vil bidra til bedre samarbeid mellom helseforetakene, styrket mikrobiologisk beredskap og mer effektiv håndtering av smitteutbrudd. Løsningen vil også være et viktig verktøy i arbeidet med å overvåke og forebygge antibiotikaresistens i Norge.